Niet getest, maar mogelijk werkt dit:
Bijna al je "shortcuts" naar applicaties staan in /usr/share/applications en eindigen op .desktop.
De rest staat in ~/.local/share/applications
Je zou het desbetreffende .desktop bestand vanuit /usr/share... kunnen kopiëren naar ~/.local/share... en dan bewerken in een teksteditor.
Bijvoorbeeld het programma "seahorse" om je wachtwoorden en sleutels te beheren:
[Desktop Entry]
Name=Passwords and Keys
Comment=Manage your passwords and encryption keys
Exec=seahorse
Terminal=false
Type=Application
Icon=seahorse
Categories=GNOME;GTK;Security;Settings;
StartupNotify=true
X-GNOME-Bugzilla-Bugzilla=GNOME
X-GNOME-Bugzilla-Product=seahorse
X-GNOME-Bugzilla-Component=general
X-GNOME-Bugzilla-Version=3.2.2
X-GNOME-DocPath=seahorse/seahorse.xml
X-Ubuntu-Gettext-Domain=seahorse
Dat programma staat onder een andere naam in de Dash, namelijk "Passwords and Keys".
De naam en commentaar kan je gewoon aanpassen, de rest zou ik zo laten. De Dash zoekt op meerdere velden, dit programma kan je ook vinden als je zoekt op "seahorse" of "password".