Toch even een waarschuwing: voor beginnende gebruikers is het niet aan te raden om Ubuntu Tweak te gebruiken. De reden hiervoor is de hoge mate van risico die je hebt om iets te doen waardoor je systeem niet meer goed werkt. Vooral voor beginners is deze risico te hoog aangezien een beginner in het begin weinig kennis zal hebben van Linux. Een ander risico is het via Ubuntu tweak toevoegen van PPA's die het beveiligingssysteem en authenticatiesysteem van Ubuntu kan omzeilen en op deze manier een groot risico creëert om je systeem onstabiel te maken. Gevorderde gebruikers die weten wat ze doen is een verhaal apart, maar voor beginnende gebruikers raad ik, vooral in het begin, Ubuntu Tweak af. Er zitten wel leuke features in Ubuntu Tweak, maar het merendeel bevat een te hoog risico-gehalte.