Bedoel je of Ubuntu bestanden die op ntfs schijven gecomprimeerd zijn opgeslaan kan lezen? Het antwoord hier is ja, maar de ntfs-3g driver kan niet zelf gecomprimeerd opslaan op ntfs. Als je dergelijk "oud" bestand bestand dus zou wijzigen en opnieuw opslaan vanuit Ubuntu, dan zal het niet-gecomprimeerd opgeslagen worden.
Als je het over gewoone, gecomprimeerde archiefbestanden hebt (zip, rar, tar.gz, ...): normaliter zijn hier geen problemen mee.