Je zou het pakket synaptic kunnen gebruiken. Daarin kan je alle aan te brengen updates laten opzoeken.
Vervolgens kan je zélf aanvinken welke pakketten je effectief wil updaten. Als je echt geen idee hebt van wat er misloopt, zal je pakket voor pakket moeten aanduiden en updaten. Dan bots je vanzelf op het pakket dat niet lukt.
(Ik heb dit zelf ook al meegemaakt (in Kubuntu), maar gewoonlijk was alles terug in orde na een paar uur wachten en terug zoeken naar te updaten programma's of onderdelen)