De persoonlijke configuratiedata van programma's wordt bewaard in verborgen folders en bestanden in je home directory. Veel programma's maken hun eigen verborgen folder (~/.mozilla, ~/.thunderbird, ~/.vim) of enkele verborgen bestanden (~/.bashrc, ~/.profile), maar de nieuwere afspraak is om die configuratie te plaatsen in een folder onder ~/.config (~/.config/google-chrome, ~/.config/nautilus).
"Opnieuw een verse installatie mogen doen" is helemaal niet aan de orde, zoals ik voorheen zei. Het volstaat, in het extreme geval, alles wat verborgen is in je home te wissen. Je data kan zonder problemen blijven bestaan. Hierdoor wordt alle gebruikersinformatie gewist. Je programma's starten met fabrieksinstellingen, en de verborgen folders zullen gaandeweg automatisch terug aangemaakt worden.
Meestal hoeft het zelfs zo een vaart niet te lopen. Zoals ik (ook) voorheen heb gezegd, zal een configuratie van een vorige versie van een programma in 99.9% van de gevallen werken op de volgende versie. Is er dan wel eens een probleem met een programma, dan kan je de verborgen informatie van dat éne programma wissen om het probleem op te lossen.