Een oplossing voor jou zou kunnen zijn ervoor zorgen dat de unity bar enkel zichtbaar wordt alsje met de muiscursor "hovert" over de linker beneden of linker bovenhoek. Je kan dat instellen in Compiz-config settings manager, Unity plugin, Behaviour, reveal mode.
Zelf vind ik Unity fijnst werken door de zijbalk nooit te verbergen: "hide launcher: never".