ik denk dat dit meer gaat om de rest van het uiterlijk, i.p.v. alleen het venster van neutilus.
als dat klopt dan komt dat omdat het commando "nautilus" ook de desktop start.
dus nautilus starten start ook de desktop opnieuw, om dat te voorkomen moet je hem als volgt openen:
gksudo nautilus --no-desktop
het venster zelf zal wel het standaard-uiterlijk hebben echter.
om dat te veranderen moet je, zoals willy2 al zij, de instellingen als root aanpassen.
je kan zoiezo, voor veiligheid, beter de --no-desktop parameter gebruiken als je hem al root start, omdat anders alles wat je met de desktop doet gelijk als root gedaan word.