Scheikundige progjes

[Ronnie]

Ik ben bezig met een biologisch/scheikundige opleiding en wil daar graag een paar progjes voor hebben

Ik zoek er een om moleculen te maken en te bekijken (het liefst 3D)

Ik heb al viewmol gedownload, maar daar moet je eerst in de config de paden naar 3 progjes instellen nl:
Moloch ?
Povray   (gevonden met locate povray)
Een afbeeldingviewer   (gthumb %F)

Weet iemand waar ik moloch kan vinden? heb er lang naar gezocht maar kan niets vinden.

Als iemand nog suggesties heeft voor andere programma's hoor ik het graag

B.V.D. Ronnie

[eendje]

ALs ik in Synaptic zoek op molecule vind ik een hele lijst met applicaties dien doen wat jij vraagt. Misschien eens een paar van installeeren en proberen? Wel even de univers repro inschakelen...

Moloch kan ik niet vinden in Synaptic.  Ik weet ook niet wat het voor programma is. Ik weet alleen dat het een afgod is uit het oude Oosten...

[Kiwinote]

Ik heb welleens gehoord van jmol. Deze zit niet in synaptic, maar is verkrijgbaar op sourceforge

[Ronnie]

in synaptic heb ik al (bijna) alles geprobeert. alleen de meeste zijn 2d of zonder grafische interface, Alleen viewmol kan ik 3d bekijken. maar die werkt nog niet helemaal

jmol, ik zal eens ff gaan kijken.

Ik heb ook al gcjempaint, ghemical, gami, ecell en VICS II maar dat zijn allemaal .tar.gz en geven elke keer een foutmelding bij het installeren.

./configure
make

en dan zegt hij dat ik pachages mis, maar die heb ik al geinstalleerd

[cotcot]

chemtool

[Arvid Van Essche]

voor een mooi periodiek tabel.
Kalzium

[Ronnie]

kalzium al geprobeert, maar is niet wat ik bedoel
Chemtool is in 2D ik heb graag 3D

Ik heb jmol uitgeprobeert op win, is precies wat ik zoek. Nu alleen nog op linux aan de gang krijgen.

Weet iemand waar een uitleg staat hoe precies een .mol file in elkaar zit, ben er al gedeeltelijk mee aan de gang, of weet iemand een programma waarmee ik moleculen kan gaan maken?

.xyz bestanden heb ik wel een aantal gemaakt, maar is niet uitgebreid genoeg (dubbele bindingen)

[budster]

Jij hebt deze pagina op de site van povray zeker gemist:

http://povray.org/resources/links/3D_Programs/Chemical_Molecular_Modelling_Programs/

Daar staan 20 chemie modellers, ze zijn niet allemaal voor het linux platform maar merendeel wel.

[Arvid Van Essche]

er zit ook een mooie screensaver in Ubuntu. Willekeurige afbeeldingen van biomoleculen. +naam

system > preferences >screensaver

Arvid

[Ronnie]

Dat klop, die heb ik al een keertje voorbij zien komen, vond hem erg leuk. Maar laat hem voorlopig op willekeurig staan