Je vergelijkt Unix filesystemen met Windows. Op zich kan dat wel, net zoals je appels met peren kunt vergelijken. Het gezegde is echter dat je geen appels met peren kan vergelijken, maar dat kan uiteraard wel. De conclusie zal dan echter zijn dat ze verschillend zijn, ondanks dat het allebei "fruit" (in deze context: fragmentatie) heet.
http://www.itworld.com/nls_unixfrag040929
Maak je geen zorgen........ ik heb in mijn 18 jarig Unix (Solaris, HP-UX, AIX, Linux) era nog geen Unix filesysteem gezien dat vanwege overmatige fragmentatie niet meer zou performen.
En als je dan toch paranoide wilt gaan worden; kijk je naar dump/restore. Maar dat staat meen ik ook in het artikel.