WibO,
Start de computer eens terug op met de LiveCD en als je op de desktop komt ga je naar Systeem>Beheer>gParted en start deze op. Hiermee kan je alle schijven die in en aan je computer zitten zien (normaal gezien toch

)
Kijk daar nu welk bestandstype er op staat. Schijf met ubuntu dus ext4 en schijf met windows waarschijnlijk ntfs.
Is dat zo dan is er dus niets aan de hand. (oef

)
Kijk hier ook eens hoe je schijven genoemd worden. Dat zal bij jou waarschijnlijk zo zijn: eerste HD= sda met op sda1 windows
En voor de tweede schijf: sdb en dus ubuntu op sdb1 of een andere cijfer.
Daarna kan je de computer gewoon herstarten en inloggen in ubuntu en grub eens herinstalleren.
Zie hiervoor:
http://sites.google.com/site/computertip/grubcitaat uit de link:
Reparatie gaat als volgt:
Open een terminalschermpje (Applications - Accessories - Terminal).
Tik in: sudo grub
en druk op Enter. Dit start Grub zelf op.
Typ root (hd0,0) en druk op Enter (als uw Linux rootpartitie op sda1 staat; Grub telt vanaf 0, vandaar dat het cijfer één lager is). Partitie 1 = 0, partitie 2 = 1, enzovoorts. Hoewel Ubuntu een harde schijf "sda" noemt, gebruikt Grub de aanduiding "hd0".
Staat de Linux rootpartitie bijvoorbeeld op sda6, dan is de terminaltoverspreuk "root (hd0,5)". Hiermee vertelt u Grub waar de actieve Linuxpartitie zit. Staat Ubuntu op een fysieke tweede harde schijf, dan is het niet hd0 maar hd1 voor Grub. Dus bijvoorbeeld root (hd1,5)
Tik in: setup (hd0)
en druk op Enter. Hiermee installeert u Grub (opnieuw) in de MBR.
Ook bij twee harde schijven geldt: Grub zelf moet in de MBR van de eerste harde schijf, dus dit commando blijft dan hetzelfde.
Tik in: quit
en druk op Enter.
Herstart de computer.