Als het is om je monitor goed te hebben, dan denk ik dat het wel degelijk de beste oplossing is om je basknop te gebruiken. Het geluid dat je uitstuurt vanuit de computer, is "linear". Klinkt het toch niet goed, dan is dat te wijten aan je monitor/opstelling, niet aan het signaal dat de computer uitstuurt. Dan lijkt het me zeker geen verkeerde praktijk om ook daar te corrigeren.
Los van die aanbeveling, ik heb geen weet van een goede systeembrede equalizer. Er is ooit wel een systeembrede equalizer ontwikkeld voor Pulseaudio, maar die is nooit stabiel geweest en gaf problemen. Ik denk dat die al een tijdje niet meer verder ontwikkeld is. Vele audioplayers hebben hun eigen equalisatiemogelijkheid. Ardour ken ik niet, maar ik denk wellicht niet, want anders zou je het wel gevonden hebben. Ook de lichtere geluidseditor Audacity heeft die mogelijkheid niet.