hm, heb je toevallig ook closed-source drivers geinstaleerd? zo ja, moet je even kijken of die ook de instellingen in xorg.conf kunnen zetten en dan die regels toevoegen.
je hebt dan namelijk kans dat hij anders standaard instellingen wil gebruiken die het niet doet met de closed-source drivers.
ik weet niet welke grafishe kaart je hebt, maar de nvidia drivers kunnen een xorg.conf configureren, ati drivers niet geloof ik.
(als ik zo zelf eens kijk in catalyst...)