Ik heb ze beide geïnstalleerd, maar dan kan je wel tegen problemen aanlopen.
Voor Java-programma's kan je kiezen welke Java je wil gebruiken (sudo update-alternatives --config java).
Voor applets die in een browservenster draaien kan je vanuit Firefox kiezen welke plugin je wil. Alleen is die keuze na een nieuwe opstart weer weg.
De problemen die ik hier zie zijn o.a. verkeerde/inconsequente verwijzingen naar de verschillende plugins. Het kan zijn dat Opera de ene plugin gebruikt en Epiphany de andere. Om alles gelijk te trekken moet je dan handmatig de verschillende symlinks aanpassen. Veel werk, vervelend en totaal niet gebruiksvriendelijk.
Tegenwoordig heb ik alle Java plugins uitgeschakeld in Firefox. Gewoon om te kijken of ik ze mis

En nee, ik mis ze niet, ik ben nog maar weinig sites tegengekomen die nog met Java werken. Het meeste is Flash tegenwoordig.