Zo te lezen draaide je Ubuntu op NTFS (een Windows File System), die je alleen kan krijgen als je Ubuntu installeert via Wubi (Windows Ubuntu Installer).
NTFS draait heel instabiel met Ubuntu.
Wat ik je dan aanraad is, download Ubuntu, brand het, reboot je PC met de CD in, en installeer Ubuntu vanaf daar.
Dan krijgt Windows wel minder schijfruimte, maar dan loopt je Ubuntu op ext3, en is dus heel stabiel.