Dit doe ik in Ubuntu met een simpele opdracht, dat moet volgens mij ook in Debian werken.
In het voorbeeld ga ik er van uit, dat de eerste harde-schijf, waar je dus van opstart /dev/sda is:
sudo grub-install /dev/sda
sudo update-grub
De eerste regel zet de juiste data in de MBR van de HD.
De tweede regel scant de HD opnieuw, maar dat is meestal niet echt nodig.