Zou het kunnen zijn dat je een nautilus extensie heb geïnstalleerd, die dan problemen zou opleveren? heb jij zoiets in de laatste tijden geïnstalleerd?
Om te bekijken wat er mis is zou ik deze 2 commando's vanuit de terminal gebruiken, en dan kijken als er foutmeldingen worden weergegeven:
sudo killall nautilus
nautilus --no-desktop