Ik zou het heel makkelijk houden, neem de 20 voor root, neem je swap en deel de andere space op in /home. De andere disk geef je dan een andere partitietabel voor eventueel kopies van bepaalde bestanden op te bewaren ofzo.
Je zou de andere schijf ook kunnen gebruiken als een opslagsysteem voor je bestanden waarmee je je /home niet wilt opvullen om het overzichtelijk te houden, bijvoorbeeld apparte partities voor films, muziek, die misschien wel eens te groot kunnen worden voor de kleinste disk en die af te zonderen in logisch genaamde partities op de tweede.
Alles is mogelijk, je moet gewoon beoordelen wat je voor opslagstrategie wenst te hebben, dat moet je met elke pc doen, normaal gezien ook met een windows pc.