Ik begrijp je vraag/probleem denk ik niet helemaal. Als je foto's uit twee verschillende mappen wilt vergelijken, kun je toch gewoon Geeqie starten en naar de eerste map gaan met de foto's die je wilt zien en dan Ctrl+N doen om een nieuwe instantie van dat programma te starten, waarna je naar de map fietst met de andere foto's die je met de eerste wilt vergelijken. (EDIT. En die twee programma-instanties dus naast elkaar op je scherm plaatsen, eind Edit). Hetzelfde verhaal voor vele andere fototoonprogramma's.