Je verhaal is mij niet helemaal duidelijk, maar een DVD-RW lijkt mij geen geschikt backup medium: beperkte levensduur en beperkte betrouwbaarheid. Een enkel-lezen-DVD is daarentegn wel vrij betrouwbaar, op voorwaarde dat de DVD meticuleus in het donker in goede omstandigheden bewaard wordt (levensduur 100+, maar het medium bestaat nog niet lang genoeg opdat iemand dat in real time heeft kunnen testen ...).
Algemeen; om twee directorystructuren identiek te maken, is "rsync" het programmatje bij uitstek. Een commando zoals
rsync -av --delete <bron>/ <bestemming>/
zal er voor zorgen dat beide directories, bron en bestemming, exact dezelfde bestanden bevatten. Opdat dit goed zou werken, moeten beide directories op partities staan, geformatterd in bestandssystemen die linux permissies ondersteunen (vb. ext3).