Hallo Wans,
Als ik het goed begrijp, dan heb je dus 2 HD's met op één HD een Win installatie.
In het volgende ga ik ervan uit, dat SDA de Windows schijf is en HDB leeg !!
Kies dan waar gevraagd wordt om de indeling op handmatig,
verwijder alles van HDB,
Maak een EXT3 partitie aan op HDB van 10GB, gemount als "/" en de bootflag aan.
Maak een EXT3 partitie aan op HDB3 (zo groot mogelijk) en mount deze als /home
Maak een swap partitie aan van 1 of 2 GB (vuistregel 2X RAM)
Eventueel kan je nog een FAT32 partitie maken, om files te delen met Windows, handig wanneer je Windows ook (nog) gebruikt.
Succes !