Opzich gaat het meestal wel goed maar eigenlijk is sudo gedit niet de bedoeling. Dat zou gksudo gedit of kdesu kate moeten zijn. Het verschil zit em er geloof ik in welk user profiel wordt gebruikt; die in de home dir van root of die in de home dir van . Om vergelijkbare redenen is het verkeerd om sudo su te doen en moet sudo -i gebruikt worden (zie ook man sudo.
Het schijnt wel eens voor te komen dat mensen hun firefox (gedeeltelijk?) hebben gesloopt door die op de verkeerde manier als root te draaien. Dingen in de sfeer van bookmarks kwijt omdat root eea heeft overschreven oid. Waarom je firefox als root zou willen draaien is mij echter een raadsel.
Anywho, gksudo is de correcte manier en dan weet je zeker dat er geen rare dingen gebeuren.