Volgens mij kan een WUBI updaten van versie 9.10 naar 10.04 wel, maar je hebt grote kans dat het fout gaat. Dit is in jouw geval dus ook gebeurd. Het beste is om Ubuntu uit te proberen via een live sessie, door Ubuntu te branden op een cd of USB stick. Daarna kies je de optie uitproberen zonder te installeren (na taalkeuze). Vervolgens kan je alles van Ubuntu uitproberen zonder dat u iets op uw harde schijf installeert.
Een live sessie gaat wel langzamer dan een gewone installatie, maar is wel veel veiliger. Zelf ben ik van mening dat je WUBI wel kan gebruiken om Ubuntu uit te proberen, maar als je al op het punt komt van een distributie upgrade dan zou ik een back up maken van je huidige bestanden, en vervolgens een schone WUBI installatie doen nadat je de oude WUBI installatie hebt verwijderd.