Probeer eens te gaan naar Systeem-->Voorkeuren-->Toetsenbord
Dan onder het tabje indeling vinkjes uitzetten voor:
Seperate layout for eagh Window
New windows use active window's layout
Ik weet niet of het in het Nederlands is, ik draai Ubuntu 10.04 (test versie) en die is nog niet 100% vertaald.
Ik heb zelf hetzelfde probleem gehad, ik tik op een toetsenbord met Dvorak indeling, maar hij schakelde teel vaak terug naar qwerty.. Ik heb toen maar Qwerty verwijdert zodat ik ook gedwongen werd dvorak te leren.
Ik weet dan ook niet helemaal zeker of dit het probleem oplost, maar je kan altijd proberen