Dat "prutsen" is er mogelijk teveel aan geweest: door andere pakketbronnen te gaan gebruiken, loop je een zeker risico dat je pakkettensysteem inconsistent wordt. Gemakkelijkste oplossing is inderdaad herinstalleren, waarbij je je schijf in eerste instantie niet hoeft te wissen: dan wordt het systeem vers geïnstalleerd, maar blijven je instellingen behouden.
Nog zekerder speel je, inderdaad, door een volledige herinstallatie, mét formatteren van al je partities. Hierdoor ga je helemaal terug naar standaard instellingen, en moet je achteraf je gegevens terugplaatsen.