Wellicht zal één of ander programma niet meer werken.
libsqlite3.so is bij mij een symbolische link naar libsqlite3.so.0.8.6. Ik vermoed dat bij jou libsqlite3.so een afzonderlijk bibliotheekbestand is, dat verschillend is van libsqlite3.so.0.8.6. Dat ze dezelfde SONAME hebben betekent dat beide bestanden functioneel equivalent zijn. Kan je even volgende output hier posten?
ls -la $(locate libsqlite3.so)
file $(locate libsqlite3.so)