386 kernel is meestal geen probleem en geen groot verschil in snelheid. Windows zelf heeft enkel een 386 versie, bij ubuntu zijn de meeste pakketten ook gewoon 386, maar kan je de kernel inderdaad 686 installeren, dit is op sommige punten een klein beetje sneller dan 386.
686 heeft wel het extra voordeel dat hij meerdere processors kan aanspreken (smp) dus dual core of dual processors, en 686 heeft ook ondersteuning voor grotere hoeveelheden ram dacht ik (4GB+ ofzo, weet niet zeker)