Kevin,
Je conf bestanden op je server worden bewaart in /etc/...
Je data bestanden op je server worden bewaart in /var/...
Dat is een regel maar geen wet.
Als je kan uitzoeken wat wel en niet voor je belangerijk is.
Kan je eerst een test doen voor dat je echt migreert
Anders vrees ik voor dat het de tweede optie wordt.
Heb je wel een schone en een nette configureerde installatie.
"Ieder nadeel heb zijn voordeel"