Waren die hogere snelheden in dezelfde versie van ubuntu of een oudere? Het kan ook komen door fragmentatie van de schijf, misschien eens in WinXP defragmenteren?
Wat ik zelf heb gedaan is de externe schijf opsplitsen in een NTFS- en ext4-partitie. ext4 gaat echt een stuk sneller bij het syncen. Dit is natuurlijk geen oplossing als je de data op die partitie ook regelmatig in Windows moet openen.