Ik denk dat je iets eerder aan de bel had moeten trekken want na de upgrade had in de terminal van ubi
sudo update-grub genoeg geweest om het weer goed te krijgen.
Als ik het goed lees heb je nu wel een werkende windows? Of is dat ook niet meer?
Start met de livecd en volg deze stappen
http://wiki.ubuntu-nl.org/GrubHerstelDan start je pc weer op met grub zonder dat je windows ziet in eerste instantie
Als ubi weer draait open je de terminal en geef je in
sudo update-grub
wachtwoord ingeven
en even wachten tot hij klaar is hierna kan je je pc herstarten en zie je dat windows weer netjes in grub staat.