Het makkelijkste is om 6.06 te overschrijven, echter ben je wel alles van 6.06 kwijt. Dus wel even je home folder back-uppen of apart zetten.
Je zult door je dualboot wel handmatig moeten partitioneren, kies hiervoor tijdens de installatie en gooi je linux partities weg, deze herken je aan EXT2 of EXT3 en SWAP. Windows zal hoogstwaarschijnlijk NTFS zijn en misschien kan gparted ook wel de namen van de partitie achterhalen, durf ik zo niet te zeggen.
Nu maak je een nieuwe partitie aan, die 2x zo groot is als je werkgeheugen (althans dat is de "standaard" regel, niks is verplicht) en deze geef je als indeling SWAP mee. Vervolgens maak je een partitie aan met de indeling EXT3 en geef je als aanknopingspunt de "/" mee, zonder quotes!
Nu kun je de installatie vervolgen.
Let op! het is wel altijd aan te raden om een back-up van belangrijke bestanden te hebben, ook van Windows. Het kan natuurlijk altijd mis gaan.