Hoe GDebi package installer werkt weet ik niet.
Hoe je software onder ubuntu installeert staat ongetwijfeld in de wiki, en anders kan iemand anders je daar wel mee helpen.
bij yast onder opensuse is het gedrag dat je noemt normaal: die verdwijnt na verloop van tijd weer zonder enige poeha.
Niet echt gebruiksvriendelijk, want als gebruiker verwacht je een bevestiging dat het gelukt is.