Kopieer de inhoud van ~/home naar een extern medium en zet deze na (nieuwe) installatie weer terug
Alternatief is om met bv Remastersys een backup te maken (van je huidige systeem + data) en daarna je schijfgrote aan te passen met Gparted van de LiveCD.
Vervolgens installeer je de backup.
Ik heb de grote van een partitie ook eens aangepast (vergroot) met Gparted, zonder dataverlies.
Het is echter verstandig om backups te hebben in case of.........