Dat kan je dan gewoon via Windows doen, met een tool zoals Partition Magic.
Normaal raden we het gebruik van Partition Magic af, maar het is meer dan geschikt genoeg om een EXT3-partitie te wissen en terug te formatteren naar NTFS.
Wat er dan met GRUB gebeurd weet ik echter niet zeker.
EDIT: Wat pjotr123 zegt klopt wel. Normaal gezien wordt er ook eerder Gparted dan Partition Magic aangeraden, dus ik raad je aan om dat te gebruiken ...