Dat sites-available en sites-enabled is volgens mij iets dat de packagemakers van Ubuntu erbij gemaakt hebben. Het is niets anders dan de instellingen van httpd.conf die in aparte bestandjes zijn gezet, met verwijzingen vanuit httpd.conf daar naartoe . Maw. je kunt dat gewoon negeren en al je instelingen in httpd.conf zetten. Je ontkomt er denk ik niet aan dat je de documentatie en wat tutorials moet doorlezen, vooral over gebruik van 'virtualhost'. Apache is gewoon een applicatie met veel mogelijkheden.