ntfs zou moeten werken, fat32 werkt ook maar is onveiliger ivm met geen journaal op file systeem, en geen grote files.
Dat er opeens andere foto's aanwezig zijn vind ik raar, heb je misschien ntfs partitie met de hand aan een map gekoppeld?
Dan zou het kunnen zijn dat er niet goed gemount wordt. Een map die je mount is eigenlijk 2 mappen, 1 niet gmount en 2 wel gemount.
Files die je in map 1 zou zetten(bij het verkeerd mounten, of niet mounten) , die zie je in map 2(wel gemount) niet.
Controleer dus of er goed gemount wordt.
En controleer of wel goed zit in de mappen.
En windows nooit in linux laten lezen of schrijven, is mogelijk, maar nooit doen.
En wat kun je niet met gimp, lijkt me sterk, je hebt ook gimp voor windows.
En kijk eens met hd tune in windows of smart van je hd, dus of je hd defect aan het gaan is.