Hallo, ik vermoed dat je naast de 'systeem' download-map er ook eentje zelf hebt aangemaakt, met dezelde naam maar op een andere locatie. Zo te lezen bevat de folder Downloads in /home/user de bestanden die je hebben wilt. Dus als ik het goed begrijp, valt er niets terug te halen. Misschien kun je onder Eigenschappen van de map Downloads die je wel ziet maar leeg is, aangeven dat die naar /home/user/Downloads moet wijzen.
EDIT. Ik zie nu dat de Downloads snelkoppeling naar je Bureaublad verwijst, dus naar /home/user/Bureaublad/Downloads. Dat heb je zelf gedaan, want dit is niet standaard. De standaard Downloads map zit onder /home/user/Downloads.