Heb nooit echte problemen bemerkt, hoogstens dubbeling van paketten, b.v. twee netwerkmanagers. Dit geeft geen problemen, want de basis is gelijk (ubuntu-minimal) en de verschillen (Kubuntu ("KDE-settings") en Ubuntu ("Gnome-settings") bijten elkaar niet. Start je de een, dan krijg je b.v. de Gnome-netwerkmanager, start je de ander dan krijg je de KDE-nerkwerkmanager.
Het netste lijkt me om alleen een *buntu te installeren en die aan te vullen met alleen de gewenste desktopmanager en programma's