Ik neem aan dat het terug zetten naar de fabrieks instellingen gaat door het herinstalleren van Windows via de herstel partitie/DVD.
Of dit effect heeft op de Ubuntu installatie is afhankelijk van het programma dat de herstel uitvoert.
Bij sommige kan je de partitie indeling bepalen. Andere overschrijven de gehele hdd/ssd.
Als je de partitie indeling al kunt bepalen is het evengoed mogelijk dat de linux partitie beschadigd raakt.
Mocht het toch zijn gelukt heb je evengoed de MBR te herstellen zodat GRUB weer start en je kan kiezen wat er opstart.
Het makkelijkst blijft evengoed om eerst Windows te installeren en daarna de Ubuntu.
Een goede gewoonte is natuurlijk om van te voren een back-up naar een externe schijf te maken.
W7 kiest vooral de bootpartitie om systeemherstel te doen. Stel: je hebt 2 partities met je gekochte laptop (of pc) 1 voor het besturingssysteem en 1 voor data (meestal voorgesteld als C en D partitie in Windows) . Moest je een systeemherstel doen dan overschrijft Windows in geen enkel geval de 2e logische partitie (en maar goed ook)/.
Dus in jouw geval moet je enkel de juiste partitie toewijzen aan het herstelprogje en dan loopt het vanzelf goed.
Enkel de MBR en Grub dien je nog even aandacht te geven.