Dat komt mogelijk doordat de geluidschip uitgezet wordt als die even niets te doen heeft. De reden: stroombesparing.
Dit kan je oplossen door /etc/modprobe.d/alsa-base.conf aan te passen.
Zoek de volgende regel op:
options snd-hda-intel power_save=10 power_save_controller=N
Verander die in:
options snd-hda-intel power_save=0 power_save_controller=N
(Ik zit nog op Ubuntu 10.04, dus als jij een nieuwere versie gebruikt kan die regel er iets anders uitzien)