Ik snap het niet helemaal. Linux werkt niet met letters, maar met mappen. Waar C: in Windows je hoofdschijf is, heet dat in Linux gewoon / . Een D: onder Linux kan dan zo heten:
/dev/sda2
/ is dus de hoofdschijf (root), dev een map waarin alle apparaten staan, sd een anduiding voor een harde schijf, a de eerste schijf in je computer en 2 duidt aan dat dit de tweede partitie op de schijf is. Ubuntu vertaalt dat allemaal mooi naar begrijpbare namen in de bestandsverkenner.
Voor zover een technisch lesje
Staan die betreffende mappen op Ubuntu of op Windows? Mogelijk heb je Ubuntu over die mappen heengeschreven.