Gaat het zoals in de hyperlink van de startpost, het om Lubuntu 14.04 met pcmanfm 1.2.0. Als ik die installeer in Ubuntu 14.04, dan worden zo te zien de verborgen bestanden niet standaard getoond. En is een wijziging via toetsencombinatie CTRL-H wel blijvend.
Je zou het volgende bestand kunnen checken.
~/.config/pcmanfm/default/pcmanfm.conf
Om de verborgen bestanden niet te tonen, zou behoren te staan in sectie [ui]
show_hidden=0