Ik kan bevestigen dat je niet de enige bent, en dat het ook niet met 'verkeerde' instellingen te maken heeft.
Ik heb hier drie laptops met Xubuntu 18.04; alle exact hetzelfde ingesteld (op alles).
Twee doen het gewoon zoals het hoort, met het update-icoon als er updates zijn. Een noteboekje van Acer komt nooit met het update-icoon.
Ik heb drie maanden geleden op een Toshiba laptop voor mijn dochter hetzelfde geïnstalleerd. Ik was bij haar haar van het weekeinde en vroeg naar haar belevenissen met Xubuntu; ook naar updates. "Nooit een melding van updates gehad", was het antwoord.
Instellingen gecontroleerd: alles goed. Toen in Synaptic gekeken: niets opwaardeerbaar! Van mijn noteboekje weet ik inmiddels dat ik op herladen moet klikken, en dan komen ze wel. Zo ook bij de Toshiba (heel veel van drie maanden).
Mijn voorlopige conclusie is, dat het hier een hardware-afhankelijk schoonheidsfoutje betreft.