FAT is een Windowsformaat. Derhalve moet je niet verwachten dat niet-Windows-besturingssystemen dat perfect ondersteunen. Ook is FAT16 een ouderwets formaat, dat waarschijnlijk om die reden niet in Schijfgereedschap is opgenomen.
Achterhaal met Schijfgereedschap de apparaatnaam van je SD-kaart (iets als /dev/sdb1). VErvolgens in een terminalvenster (ctr+alt+t):
sudo mkdosfs -F 16 APPARAATNAAM
Waar je dus je apparaatnaam moet invullen.