Ik denk ook dat wat jij aangeeft niet onder de noemer "kwaaltjes" thuishoort, hoewel de kwaaltjes er ongetwijfeld zijn, ook onder Ubuntu. Je hebt massaal veel geïnstalleerd en massaal veel verwijderd, dus kan er (1) ondertussen wel wat te veel weggehaald zijn en kunnen er (2) configuratieproblemen zijn ter hoogte van je account.
Voor (1) moet je eens ubuntu-desktop herinstalleren: "sudo apt-get install ubuntu-desktop" (of gebruik pakketbeheer). Als er al iets te veel weg is, dan zal dit commando alles wat bij het basissysteem hoort, terugzetten.
Als er dan nog problemen zijn, identificeer ze goed. Ofwel repareer je handmatig, mar je kan ook gewoon je ganse account "resetten". Bijvoorbeeld, een netwerkicoon dat weg is, dat kan je er gewoon weer bijzetten: ubuntu zal dat niet automatisch doen (de filosofie is dat jij, en niet het systeem, bepaalt hoe je desktop ingericht is).
Om je account te resetten, kan je gewoon een nieuwe creëren. Ik garandeer (bijna) dat alles dan meteen terug werkt "out of the box" (als je (1) gedaan hebt, tenminste). Wellicht wil je echter je oude accountnaam terug, en dan wordt het wat omslachtiger (als we het op een eenvoudige en veilige wijze doen):
0) Verplaats je gebruikersbestanden weg van je home directory (/home/jegebruikersnaam) = heb ten allen tijde een goede backup
1) maak een nieuwe account. Geef die *alle* rechten (inclusief root).
2) log in op die nieuwe account, wis je oorspronkelijke account
3) wis ook nog eens je oude home directory (als beheerder, natuurlijk)
4) voeg nu een nieuwe gebruiker toe met je oorspronkelijke loginnaam. Geef die alle rechten.
Daarna kan je terug inloggen met je gewone login naam, en alles zou op "fabrieksinstelling" moeten staan.
Er zijn nog veel gemakkelijker en vluggere manieren om dit te doen, mar dat gaat via de commandoprompt en je moet al goed weten wat je doet, vandaar enkel aanbevelingen voor de "fool proof" methode.