Nee, dat is geen verlies van kwaliteit. De compressie van FLAC is verliesloos. De betere compressie leidt tot kleinere bestanden maar duurt langer, da's alles. Daarom krijg je de keuze. Op moderne snelle computers kies je best gewoon de beste compressie, maar als je meer opslagruimte hebt dan je ooit gevuld krijgt, maakt het ook niets uit wat je kiest.