Wat al gezegd is, ntfs is handigste, ook standaard keuze van windows volgens mij voor grote schrijven (groter dan klein usb stickje)
Met ook op toekomst zou ik ook voor USB 3 gaan. Snelheidswinst is zeer goed te merken tussen USB 2 en 3 en zeker met schrijf van 1TB waar je nog wel even mee wilt doen lijkt mij is dat handige keuze. Scheelt in toekomst hoop tijd met dingen backuppen of terugzetten.
PS: USB 3 is als goed is backwards compatible. Dus schrijf kopen waar alleen usb 3 op staat zou geen probleem moeten zijn. (enige punt kan zijn dat USB 3 meer stroom kan leveren, en dat een schrijf die op USB 3 geen extra voeding nodig heeft, deze op usb 2 wel nodig heeft)