Op Ubuntu GNOME 13.10 is dat wel te doen, op Ubuntu 13.10 helaas niet. De notificaties zelf kunnen wel via systeemnotificaties gaan als je een plugin installeert maar dat is het dan ook. In Skype zelf kun je ook zien wat voor meldingen je hebt. Er staat dan een bolletje met getal op de werkbalk van het hoofdvenster.