Ik zou eerder aanraden onder het klassieke /mnt te mounten als het over een permanente schijf gaat. Als je onder /media mount, zal je een icoon op je desktop krijgen. Ik vind dit handig voor verwijderbare media, maar niet voor vaste partities.
Op zich is er niets fout aan te mounten onder /disk-1, /disk-2, alleen is het niet "standaard".
Als je systeem door meerdere gebruikers gedeeld wordt, en iedere gebruiker zijn eigen gegevens erop moet kunnen zetten, dan zou ik de mount point aan de root laten. Als systeembeheerder creëer je dan de directories voor iedere gebruiker en ga je dan die directories aan de verschillende gebruikers geven. Tenslotte creëer je links arnaar toe in de homes van de gebruikers.