Als je een schijf bij wil die steeds aan dezelfde computer is gekoppeld, kan je uiteraard een interne schijf overwegen. De performantie van interne schijven is hoger dan die van een usb schijf. Een externe schijf daaarentegen installeer je gemakkelijker, en neem je zo mee naar je volgende PC. Als je overweegt om je home naar je tweede schijf over te zetten, dan moet je voor een interne schijf gaan. Partitioneren: dat is voor een groot deel een keuze volgens je behoeften.
Wat het formateren betreft: veel kans dat je schijf fat32 geformatteerd is. fat32 kan gelezen worden door Linux, Apple en MS Windows. Andere bestandsformaten zijn "robuster", maar zijn minder compatibel. Gebruik je zowel Windows als Linux, dan ga je wellicht best voor ntfs. Als je enkel Linux gebruiker bent, dan is er geen twijfel: maak het ext3. Als je de (interne) schijf voor je /home wil gebruiken, dan moét het een Linux-eigen bestandssysteem zijn.
De vraag is ook hoe ervaren je bent: als je ervaring beperkt is, verplaats dan je home directory maar niet. Je kan met symbolic links ervoor zorgen dat de meeste gegevens van je home directory ook op de nieuwe harde schijf komen.