Flyerman,
Het gemakkelijkst volgens mijn menig zal de oude HD clone naar de SSD met een of ander voorkeur programma (clonezilla).
Eerst niet vergeten de 12.04 helemaal up-to-date brengen.
Daarna een upgrade naar 14.04 (do-release-upgrade).
De configuratie bestanden op de Server worden meestal bewaart in /etc/.., de omvang van deze folder zal best meevallen.
De bestanden op de Server, die worden bewaart in /var/..., deze kan dus in de tientallen Gigs zijn.
Gaan uitzoeken wat je wel en niet nodig heb is volgens mijn niet echt doenbaar.